Після того, як силосовану масу заклали в силосну траншею і герметично вкрили, в ній починають відбуватися найрізноманітніші біологічні процеси.

Молочно-кисле бродіння: молочнокислі бактерії (МКБ), що зустрічаються на кормових рослинах, перетворюють рослинний цукор на молочну кислоту.  Порівняно з іншими кислотами бродіння молочна кислота є сильною, завдяки чому призводить до різкого зниження рівня рН. Це є бажаним, оскільки забезпечує оптимальне зберігання силосу. За швидкого перекриття доступу повітря молочнокисле бродіння розпочинається вже за кілька годин після вкриття силосу. Частка молочної кислоти в хорошому силосованому кормі повинна становити 80% вмісту всіх кислот.